ARN no codificante de cadena larga en respuesta a estrés abiótico en híbridos de Eucalyptus nitens x Eucalyptus globulus.

Abstract

Los retos que presentan las organizaciones productivas en cuanto a investigación y desarrollo para la producción de madera van en incremento. Los progresivos aumentos en la demanda de las comunidades, el mercado y los desafíos que propone el cambio climático exigen mayores esfuerzos en la búsqueda de eficacia y eficiencia en los procesos de cultivo orientados a la producción de madera. Ante los múltiples factores limitantes para el mejoramiento genético, provenientes del desconocimiento de los procesos moleculares involucrados en el desarrollo de Eucalyptus, se hace necesario proponer nuevas metodologías para revelar la maquinaria molecular involucrada en la respuesta de estrés abiótico. El presente estudio buscó revelar la influencia de ARNs no codificante de cadena larga (lncRNAs) en la respuesta a estrés por baja temperatura. La metodología propuesta buscó complementar las fortalezas y debilidades de diferentes herramientas bioinformáticas para dilucidar, en base a la expresión de lncRNA en respuesta a aclimatación a baja temperatura, el rol de los lncRNAs en la respuesta a estrés por baja temperatura en un híbrido de Eucalyptus globulus x Eucalyptus nitens. Como resultado, se identificaron 22 lncRNAs que podrían participar en la modulación de la expresión de genes de respuesta a estrés por baja temperatura en el híbrido. Dichas proteínas podrían estar involucradas en diferentes procesos de respuesta a estrés por frío. En base a los resultados y la información asociada con análisis en otras especies vegetales se concluye que, en base a la abundancia de transcritos de los lncRNA y la expresión in silico de los genes objetivos putativos, existiría regulación de la expresión génica en respuesta a estrés por bajas temperaturas por parte de los lncRNAs.

The challenges presented by productive organizations in terms of research and development to produce wood are increasing. The progressive increases in the demand of the communities, the market and the challenges posed by climate change demand greater efforts in the search for effectiveness and efficiency in the cultivation processes oriented to the production of wood. Given the multiple limiting factors for genetic improvement, coming from the ignorance of the molecular processes involved in the development of Eucalyptus, it is necessary to propose new methodologies to reveal the molecular machinery involved in the abiotic stress response. The present study sought to reveal the influence of long-chain non-coding RNAs (lncRNAs) on the response to lowtemperature stress. The proposed methodology sought to complement the strengths and weaknesses of different bioinformatics tools to elucidate the role of lncRNAs in the response to low-temperature stress in a Eucalyptus globulus x Eucalyptus nitens hybrid. As a result, 22 lncRNAs were identified that could participate in the modulation of the cold responsive genes associated in the hybrid. Based on the results and the information associated with analyzes in other plant species, it is concluded that, based on the abundance of lncRNA transcripts and the in silico expression of the putative target genes, there would be regulation of gene expression in response to stress by low temperatures by the lncRNAs.