Perfil transcriptómico de factores de transcripción en respuesta a aclimatación por baja temperatura de un genotipo híbrido de eucalyptus nitens x eucalyptus globulus.

Abstract

El cultivo del género Eucalyptus esta principalmente predominado por E. globulus y E. nitens donde E. globulus posee importancia económica, gracias al crecimiento que este posee y a la calidad de su madera, por otro lado, E. nitens posee mayor crecimiento, como también por ser resistente a heladas y tolerante a fríos extremos. Uno de los programas de mejoramiento importante, es la hibridación entre E. nitens y E. globulus, que busca las características de enraizamiento y propiedades de la madera de E. globulus y la alta tasa de crecimiento junto con la tolerancia al frio de E. nitens. En este estudio de análisis in silico se caracterizó el perfil transcriptómico de 855 factores de transcripción de 53 familias diferentes del híbrido E. nitens x E. globulus en respuesta a la aclimatación por bajas temperaturas y temperaturas de congelamiento, a su vez se obtuvo que las familias con mayor regulación negativa entre las combinaciones de tratamientos fueron bHLH, WRKY, y, MYB_related, por otro lado, se obtuvo que las familias bHLH, WRKY, NAC, MYB presentaron mayor regulación positiva. De todos los factores de transcripción expresados diferencialmente EnigloWRKY 5, EnigloMYB_related 31, EnigloMYB 39, EnigloGRAS 30, EnigloGRAS 30, EnigloNAC 13, arrojaron un aumento en su expresión. También se obtuvo que EnigloNAC 42, EnigloNAC 37, EnigloNAC 6, EnigloE2F/DP 1, y, EnigloARF 3 se encontraron relacionados en diversos procesos biológicos dentro del transcriptoma, siendo candidatos para futuros estudios.

The cultivation of the genus Eucalyptus is mainly dominated by E. globulus and E. nitens, where E. globulus has economic importance, thanks to the quality of its wood, E. nitens has higher growth rate, as well tolerance to frost. One of the important breeding programs is the hybridization between E. nitens and E. globulus, looking for rooting features and wood properties of E. globulus, and the high growth rate together with the cold tolerance of E. nitens. In this in silico study, characterization of the transcriptomic profile of hybrids under cold acclimation treatments were performed. In this analysis 855 transcription factors from 53 different families off the hybrid E. nitens x E. globulus, in response to cold aclimatation and frost temperatures, obtained. Among them, turn it was obtained that the families with most negative regulation were bHLH, WRKY, and MYB_related, in other hand, the families with most positive regulation were bHLH, WRKY, NAC, and MYB. Between all transcription factors differentially expressed EnigloWRKY 5, EnigloMYB_related 31, EnigloMYB 39, EnigloGRAS 30, EnigloGRAS 30, and EnigloNAC 13 exhibited an increase in their expression. Also, it was obtained that EnigloNAC 42, EnigloNAC 37, EnigloNAC 6, EnigloE2F/DP 1, y, EnigloARF 3 were found related in various biological processes within the transcriptome, being candidates for future studies.